背景: 在欧洲人群中，全基因组关联研究(GWAS)已鉴定出100多个精神分裂症相关基因座。独特的印度人口中的精神分裂症GWAS提供了新发现。
实验目的: 发现并在功能上评估印度独特人群GWAS中精神分裂症的遗传位点。
实验方法: 本GWAS包括受影响个体，家庭成员以及无关病例和对照的样本。招募了392个人，并通过金奈及周边地区的病历，医院，诊所和临床网络进行了诊断确定。受影响的参与者符合精神分裂症的DSM-IV诊断标准。无关对照者没有精神病的个人或家族病史。从2001年1月1日开始连续连续进行招聘，基因分型和分析。招聘工作已于2018年2月28日完成，并且正在进行基因分型和分析。单核苷酸多态性和基因表达与精神分裂症的关联。
实验结果: 研究人群包括1321名精神分裂症患者，885名家庭对照者和886名无关对照者。在精神分裂症参与者中，平均(SD)年龄为39.1(11.4)岁，男性为52.7%。该样本显示出统一的种族，近交程度和滥用率可忽略不计。在精神分裂症和染色体8q24.3基因位点(rs10866912，等位基因A;优势比[OR]，1.27 [95%CI，1.17-1.38];P = 4.35×10 -8)之间发现了新的全基因组显着关联精神分裂症精神病基因组学联盟2数据(rs10866912，等位基因A; OR，1.04 [95%CI，1.02-1.06]; P = 7.56×10 -4)。该基因座已经过自然选择，风险等位基因A的频率从印度(大约72%)到欧洲(大约43%)下降。rs10866912直接修改大脑皮层中烟酸磷酸核糖基转移酶基因(NAPRT1)转录本的丰度(标准化效应量，0.79; 95%CI，0.6-1.0;P = 5.8×10 -13)。NAPRT1编码烟酸代谢的关键酶。在印度淋巴母细胞系中，rs10866912的(风险)等位基因A 与NAPRT1下调相关(AA：0.74，n = 21; CC：1.56，n = 17;P = 0.004)。斑马鱼的初步数据进一步表明，斑马鱼的部分功能丧失NAPRT1导致异常的大脑发育。
结论: 生物信息学分析以及细胞和斑马鱼的基因表达研究表明NAPRT1是一种新型的易感基因。鉴于该基因在烟酸代谢中的作用，以及烟酸缺乏引起神经精神疾病(例如糙皮病和Hartnup病)的精神分裂症样症状的证据，这些结果表明rs10866912的基因型和烟酸状态可能对精神分裂症的易感性和治疗有影响。
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